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龙图腾网获悉电子科技大学长三角研究院(衢州)申请的专利一种基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的transformer模型获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120183487B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-12发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510655862.6，技术领域涉及：G16B15/30；该发明授权一种基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的transformer模型是由刘利;刘晨阳;邹权;林昊设计研发完成，并于2025-05-21向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的transformer模型在说明书摘要公布了：本发明提供了一种基于转录因子交叉注意力预测增强子‑启动子相互作用的transformer模型，它解决了现有的增强子‑启动子相互作用预测方法可解释性有限等问题，其包括输入层，输入层通过卷积特征提取模块与正余弦位置编码模块连接，正余弦位置编码模块通过交叉注意力编码器层和多层前馈网络模块连接。本发明具有可解释性好、预测精度高等优点。

本发明授权一种基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的transformer模型在权利要求书中公布了：1.一种基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的预测方法，采用了基于转录因子交叉注意力预测增强子-启动子相互作用的transformer模型，其中transformer模型包括输入层，所述的输入层通过卷积特征提取模块与正余弦位置编码模块连接，所述的正余弦位置编码模块通过交叉注意力编码器层和多层前馈网络模块连接，其特征在于，包括如下步骤： S1：数据获取与预处理，构建增强子和启动子互作预测的数据基础； S11：下载GM12878和K562细胞系的26个关键转录因子的ChIP-seq数据； S12：获取增强子和启动子配对信息的文件、转录起始位点信息的文件以及GM12878和K562细胞类型的训练集文件； S2：增强子与启动子区域标准化，统一区域定义和坐标处理； S21：增强子处理，以增强子中心点向两侧扩展3kb，生成6kb标准化区域； S22：启动子处理，整合转录起始位点信息，定义转录因子位点±2.5kb为启动子区域； S23：数据筛选，保留在增强子-启动子配对区域内strand信息匹配的有效样本，去除多对多匹配和无strand匹配的样本； S3：关键转录因子特征编码与输入张量生成，将关键转录因子结合信息转化为结构化输入； S31：对转录因子的ChIP-seq文件进行解析，提取转录因子的结合峰顶点位置以及结合强度； S32：为每个转录因子分配唯一字符编码，构建统一的编码字典并存储为JSON文件； S33：对每个增强子或启动子区域，在其坐标范围内提取所有与之重合的转录因子结合位点，按位置顺序生成转录因子编码序列并记录对应的结合强度数值列表，若为负链启动子，则将其序列反向处理； S34：对转录因子序列进行one-hot编码，并额外增加一列来表示该位置转录因子的结合强度，生成张量表示； S35：对增强子与启动子序列分别设定最大长度，对不足部分以零向量填充，超长则截断，输出标准化模型输入张量； S4：模型架构设计，构建融合局部特征与全局交互的transformer模型； S5：模型训练与评估，优化测量与鲁棒性验证； S6：利用transformer模型内部的跨注意力机制，对增强子与启动子区域的转录因子相互作用进行可解释性分析。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人电子科技大学长三角研究院(衢州)，其通讯地址为：324003 浙江省衢州市柯城区成电路1号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。