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广西医科大学安三奇获国家专利权

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龙图腾网获悉广西医科大学申请的专利一种单细胞m6A甲基化谱的预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116364191B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310126069.8,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种单细胞m6A甲基化谱的预测方法是由安三奇;李玥琪;褚洁梅;梁浩;韦吴迪;李文兴;李静怡;叶力;蒋俊俊;胡小鹏;林垚设计研发完成,并于2023-02-16向国家知识产权局提交的专利申请。

一种单细胞m6A甲基化谱的预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开一种通过机器学习技术,基于基于反式m6A调控因子表达谱和顺式m6A序列组合特征在单细胞中预测m6A甲基化谱的方法,包括建立单细胞m6A甲基化谱预测模型和基于该模型进行单细胞m6A甲基化谱预测。本发明构建的批量预测模型拟合效果好,定义真实值和预测值差值在‑0.5~0.5范围内为真,范围外为假,绘制ROC曲线,4162个模型的平均AUC能达到0.91,且预测速度快,包含上万个单细胞的样本的预测时间只需要几分钟。

本发明授权一种单细胞m6A甲基化谱的预测方法在权利要求书中公布了:1.一种单细胞m6A甲基化谱的预测方法,其特征在于,包括建立单细胞m6A甲基化谱预测RFR模型和基于该RFR模型进行单细胞m6A甲基化谱预测,其中建立单细胞m6A甲基化谱预测RFR模型包括以下步骤: 步骤1、从GEOGeneExpressionOmnibus数据库中收集所有的m6A调控因子转录组数据和m6A-seq数据,然后提取全部的m6A反式调控因子和顺式motif序列信息,和对应m6A甲基化水平的调控网络关系; 步骤2、获得所有的m6A调控因子的基因表达谱数值和m6A甲基化谱数值,并进行标准化转换处理; 步骤3、将处理后的单细胞m6A矩阵进行共表达网络分组,使用HOMER计算每个分组中基因的m6Amotif数值,将符合DRACH模式且p值最小的序列的各个ACGT的占比整理成矩阵,与单细胞m6A调控因子矩阵合并; 步骤4、根据共表达水平对单细胞m6A进行降维,计算单细胞m6A甲基化谱与m6A调控因子的相关性,得到一一对应的单细胞m6A反式调控因子-顺式motif矩阵和单细胞m6A甲基化谱矩阵; 对得到的成对匹配的矩阵进行RFR模型构建,将单细胞m6A反式调控因子和顺式motif矩阵作为RFR模型输入,单细胞m6A甲基化谱矩阵作为监督学习的目标变量;将全部样本划分为训练集、测试集,训练集做5折交叉验证;给定参数,训练集用于构建RFR模型,测试集用于验证RFR模型回归预测性能。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广西医科大学,其通讯地址为:530021 广西壮族自治区南宁市双拥路22号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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