西安电子科技大学黄晓太获国家专利权
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龙图腾网获悉西安电子科技大学申请的专利基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统及方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116741279B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310564195.1,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统及方法是由黄晓太;张晓纪设计研发完成,并于2023-05-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统及方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统及方法,本发明从单细胞稳态基因表达矩阵中提取每个目标基因的拓扑约束,在每个目标基因拓扑约束的基础下,结合单细胞稳态基因表达数据和单细胞时序基因表达数据推断基因调控关系,得到基因调控网络。由于本发明中的拓扑约束提取模块提取每个目标基因的拓扑约束,在拓扑约束下进行后续的基因调控网络推断,提高了基因调控网络推断的准确性,降低了系统的运行成本。本发明使用Borda投票法结合从单细胞稳态基因表达数据和单细胞时序基因表达数据得到的调控关系,进一步提升了基因调控网络推断系统的准确性。
本发明授权基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统及方法在权利要求书中公布了:1.一种基于单细胞稳态和时序的基因调控网络推断系统,包括拓扑约束提取模块、调控关系结合模块、基因调控网络生成模块,其特征在于,还包括稳态调控关系推断模块,时序调控关系推断模块;其中: 所述拓扑约束提取模块,使用WGCNA聚类方法,从单细胞稳态基因表达矩阵中提取每个目标基因的拓扑约束; 所述稳态调控关系推断模块,在每个目标基因的拓扑约束下,生成该目标基因与其它基因之间的调控关系向量,将所有目标基因的调控关系向量组成单细胞稳态基因表达数据的调控关系矩阵A; 所述时序调控关系推断模块,在每个目标基因的拓扑约束下,生成该目标基因与其它基因之间的调控关系向量;将所有目标基因的调控关系向量组成单细胞时序基因表达数据的调控关系矩阵B; 所述调控关系结合模块,使用Borda投票法,分别对调控关系矩阵A和B打分,得到所有基因之间存在调控关系的可能性排名; 所述基因调控网络生成模块,通过参数因子生成基因调控网络。
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