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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所朱波获国家专利权

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龙图腾网获悉中国农业科学院北京畜牧兽医研究所申请的专利一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120108495B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510579601.0,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法是由朱波;李俊雅;张元旭;高会江;高雪;王泽昭;陈燕;张路培;徐凌洋;李宏伟;梁忙设计研发完成,并于2025-05-07向国家知识产权局提交的专利申请。

一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法,所述方法包括:步骤一、构建参考群体并测定重要分类性状;步骤二、对华西牛采血保存,提取DNA并进行基因分型得到各个SNP位点的基因型;步骤三、对于华西牛个体,使用plink2软件将基因型文件和表型文件进行关联得到汇总统计数据;并将每个SNP位点根据染色体的位置进行分块以得到LD参考文件;步骤四,将汇总统计数据和LD参考文件作为无参贝叶斯模型的输入文件计算得到SNP位点的效应值;将候选个体的基因型向量与位点效应值向量相乘得到基因组估计育种值。本发明的目的是建立基于无参贝叶斯基因组选择技术的华西牛分类性状的选育方法,为优质华西牛的培育提供分子育种方法以推动肉牛种业的快速发展。

本发明授权一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法在权利要求书中公布了:1.一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法,其特征在于,包括: 步骤一、构建参考群体并测定每头华西牛的重要分类性状; 步骤二、对参考群体的每头华西牛采血保存,提取DNA并利用生物芯片进行基因分型以得到各个SNP位点的基因型,对基因分型后的数据进行质量控制; 步骤三、对于每头华西牛个体,将步骤二得到的基因型文件和步骤一记录的表型文件进行关联分析得到每个表型的汇总统计数据,并将每个SNP位点根据染色体的位置进行分块以得到LD参考文件;其中,汇总统计数据包括SNP位点的名称、等位基因频率、回归系数、显著性水平和初始位点效应值LD参考文件包括每条染色体划分的区段、每条染色体对应的SNP位点及等位基因频率; 步骤四、对于每个表型,将各个华西牛个体的汇总统计数据和LD参考文件作为预先构建的无参贝叶斯模型的输入文件,以计算得到SNP位点的效应值;将候选个体的基因型向量与位点效应值向量相乘得到候选个体对于该表型的基因组估计育种值; 构建的无参贝叶斯模型表示如下: ; 其中,表示表型向量,X表示N×p的基因型矩阵;N表示个体数,p表示位点数; 表示p×1的位点效应值向量,其中遵循平均值为0和方差σ 2 的正态分布,将迪利克雷过程置于σ 2 ,σ 2 ~DP(H,),H表示基本分布,表示控制σ 2 上分布向H收缩的浓度参数;表示残差; SNP位点的效应值的计算过程表示如下: ; 其中,表示初始位点效应值;表示无参贝叶斯模型的超参数;表示随机权重并独立于,满足0≤≤1且,表示从分布中独立生成的随机变量,1和均为分布参数;表示随机分布;表示假设的初始先验分布表示LD矩阵;表示正态分布;表示单位矩阵。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,其通讯地址为:100193 北京市海淀区马连洼街道圆明园西路2号中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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