天津大学四川创新研究院李国良获国家专利权
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龙图腾网获悉天津大学四川创新研究院申请的专利一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115359843B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211035029.4,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法及系统是由李国良;张也;刘原驰;吉祥宇;彭德华;陆嘉华;陈建邦;陈星霖;章璐;李美伊设计研发完成,并于2022-08-26向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法及系统,该方法包括如下步骤:S1:通过软磁盘阵列RAID实现碱基测序数据管理;S2:基因解析碱基序列并自定义编号;S3:计算每条测序片段reads两组特定长度的前后质心值;S4:通过每条测序片段reads的碱基序列和编号readID构建B+树索引;S5:使用人工智能算法或数值快排算法生成ID对接表;S6:根据ID对接表多线程组装小型重叠群smallcontig,输出线程标识表、小型重叠群smallcontig片段及其编号和单核苷酸变异SNP信息表;S7:根据线程标识构建德布莱英图DeBrujinGrapph并寻路,将小型重叠群smallcontig组装为重叠群contig;S8:基于重叠群contig组装框架序列scaffold。本发明彻底破除了生物信息学组装的内存过大难题,降低了组装错误风险。
本发明授权一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于基因数值化表达的二代从头组装方法,其特征在于,包括如下步骤: S1:通过软磁盘阵列RAID实现碱基测序数据管理; S2:基因解析碱基序列并自定义编号; S3:计算每条测序片段reads两组特定长度的前后质心值; S4:通过每条测序片段reads的碱基序列和编号readID构建B+树索引; S5:应用人工智能算法获得前后质心值与碱基序列对齐关系的匹配模型,或使用数值快速排列算法将质心值顺次排序,据此生成ID对接表并优化; S6:根据ID对接表多线程组装小型重叠群smallcontig,输出线程标识表、小型重叠群smallcontig片段及其编号和单核苷酸变异SNP信息表; S7:根据线程标识构建德布莱英图DeBrujinGrapph并寻路,将小型重叠群smallcontig组装为重叠群contig; S8:基于重叠群contig组装框架序列scaffold。
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