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深圳智药信息科技有限公司黄韬获国家专利权

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龙图腾网获悉深圳智药信息科技有限公司申请的专利信使核糖核酸序列设计方法、装置、计算设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119541638B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-29发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311113680.3,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权信使核糖核酸序列设计方法、装置、计算设备及存储介质是由黄韬设计研发完成,并于2023-08-31向国家知识产权局提交的专利申请。

信使核糖核酸序列设计方法、装置、计算设备及存储介质在说明书摘要公布了:本发明涉及生物制药技术领域,公开了一种信使核糖核酸序列设计方法、装置、计算设备及存储介质。所述方法在一条给定的5’UTR序列作为起始输入的基础上,通过使用生长法逐一加入新的密码子,并进行整体序列的全长最小自由能和密码子使用效率计算打分排序,使用淘汰法排除掉含有酶切位点不良性质或得分较差的序列,再使用集束聚类搜索法挑选具有代表性的序列以增加多样性,最终获得序列进行推荐合成。本发明提出了一种在有5’UTR和3’UTR环境下的mRNA序列优化设计方法,兼顾mRNA序列的全长最小自由能和CDS区域的密码子使用效率,可以同时优化这两个目标,可以在整体分子角度来优化其稳定性,并同时优化了CDS区域的可表达性,保证了mRNA序列的稳定性和可表达性。

本发明授权信使核糖核酸序列设计方法、装置、计算设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种信使核糖核酸序列设计方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤S1:在给定的信使核糖核酸序列末尾分别添加编码蛋白的第一个氨基酸对应的所有可能密码子中的1个密码子,生成一组初始序列,并将所述初始序列放入一个序列池中;其中,所述序列末尾只添加1个密码子,并且每个密码子只被添加一次; 步骤S2:判断所述序列池中的序列数量是否大于搜索深度D; 若否,则执行步骤S3:在所述序列池中的所有序列末尾分别添加编码蛋白的下一个氨基酸对应的所有可能密码子中的1个密码子,从而生成一组新序列,并返回执行步骤S2;其中,所述序列末尾只添加1个密码子,并且每个密码子只被添加一次; 若是,则执行步骤S4:计算所述序列池中的每条序列的全长最小自由能MFEwhole和CDS区域的密码子使用效率CAICDS; 步骤S5:根据所述全长最小自由能MFEwhole和所述CDS区域的密码子使用效率CAICDS,计算所述序列池中的每条序列的得分,并根据所述得分对所述序列池中的所有序列进行排序; 步骤S6:根据预设的过滤规则或者淘汰率,过滤所述序列池中不符合要求的序列或者淘汰所述序列池中排名靠后的序列,剩余保留序列; 步骤S7:根据所述搜索深度D,将所述保留序列聚类为D类,并将每一类中得分最高的序列保留在所述序列池中,淘汰其余序列; 步骤S8:判断所述编码蛋白的所有氨基酸对应的密码子是否都被添加完毕; 若否,则返回执行步骤S3;若是,则执行步骤S9:在所述序列池中的所有序列末尾分别添加3'UTR序列; 步骤S10:计算所述序列池中添加3'UTR序列后的每条序列的全长最小自由能MFEwhole和CDS区域的密码子使用效率CAICDS; 步骤S11:根据所述全长最小自由能MFEwhole和所述CDS区域的密码子使用效率CAICDS,计算所述序列池中添加3'UTR序列后的每条序列的得分,并根据所述得分对所述序列池中添加3'UTR序列后的所有序列进行排序; 步骤S12:根据推选序列的数量R,将所述序列池中添加3'UTR序列后的所有序列聚类为R类,并将每一类中得分最高的序列推荐为设计的信使核糖核酸序列。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳智药信息科技有限公司,其通讯地址为:518118 广东省深圳市坪山区坪山街道六联社区坪山大道2007号创新广场C1116-C1119;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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