北京市神经外科研究所;香港科技大学柴睿超获国家专利权
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龙图腾网获悉北京市神经外科研究所;香港科技大学申请的专利一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法、设备及程序产品获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119741966B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411906130.1,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法、设备及程序产品是由柴睿超;王吉光;尚海霞;阮钰燕设计研发完成,并于2024-12-23向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法、设备及程序产品在说明书摘要公布了:本申请涉及智能医疗领域,具体涉及一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法、设备及程序产品。包括获取待测样本的转录数据、CNV数据、甲基化CPG探针;对甲基化CPG探针、转录因子、CNV数据处理后进行回归计算得到回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因;基于所述回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因进行基因变异分析得到甲基化CPG位点。本申请的甲基化位点筛选考虑了多组学的特征,具有很好临床价值。
本发明授权一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法、设备及程序产品在权利要求书中公布了:1.一种约束多组学的甲基化CPG位点筛选方法,其特征在于,包括: S1、获取待测样本的基因表达数据,包括转录数据、CNV数据、甲基化CPG探针; S2、对转录数据进行差异计算得到差异表达基因; S3、对转录数据进行相关性计算得到转录因子的相关性; S4、当转录因子的相关性为负相关,对负相关转录因子赋负值得到转换转录因子; S5、对甲基化CPG探针赋负值得到转换甲基化CPG探针; S6、将转换甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因进行回归计算得到回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因; S7、基于所述回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因进行基因变异分析得到甲基化CPG位点; 所述转录因子进行相关性计算得到相关性排序,保留排序前N个转录因子,N为大于2的自然数; 对所述甲基化CPG探针进行筛选得到筛选甲基化CPG探针,对所述筛选甲基化CPG探针进行赋负值转换得到转换甲基化CPG探针;其中所述筛选是进行甲基化高于预设阈值或甲基化低于预设阈值的探针筛选; 所述甲基化的筛选还包括相似性筛选,对所述筛选甲基化CPG探针进行相似性计算得到相似甲基化CPG探针,对所述相似甲基化CPG探针进行赋负值转换得到转换甲基化CPG探针; 所述相似甲基化CPG探针是根据相似度排序后的前L个相似甲基化CPG探针,L为大于2的自然数; 所述赋负值是乘以负一; 所述方法还包括差异表达基因赋负值,计算差异表达基因的相关性,对负相关的差异表达基因进行赋负值转换得到转换差异表达基因;将所述转换甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据、差异表达基因、转换差异表达基因进行回归计算得到回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据、差异表达基因、转换差异表达基因; 所述方法还包括多尺度转换,将转换甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据、差异表达基因进行归一化得到归一甲基化CPG探针、归一转录因子、归一转换转录因子、归一CNV数据、归一差异表达基因,将所述归一甲基化CPG探针、归一转录因子、归一转换转录因子、归一CNV数据和归一差异表达基因进行回归计算得到回归的甲基化CPG探针、转录因子、转换转录因子、CNV数据和差异表达基因。
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