江南大学丁彦蕊获国家专利权
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龙图腾网获悉江南大学申请的专利一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116153436B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-22发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310147520.4,技术领域涉及:G16C20/70;该发明授权一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法是由丁彦蕊;高家璇设计研发完成,并于2023-02-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法,属于计算机辅助药物设计领域。所述方法采用可以利用时间序列信息计算物质之间的因果关系得分的CCM算法发现复方中药代谢过程中各物质间的局部和全局因果关系,通过滑动窗口技术结合加权的皮尔逊相关性构建动态物质‑物质相关网络,利用PisCES算法检测代谢过程中的刚性物质簇,进一步利用复杂网络的动态拓扑属性分析物质的重要性从而确定在代谢过程中的核心物质以及核心物质群,本申请方法通过全面的挖掘中药代谢过程中物质与物之间的动态相关性,为新药研发提供新的视角与方法。
本发明授权一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法在权利要求书中公布了:1.一种中药代谢过程中核心物质以及核心物质群确定方法,其特征在于,所述方法包括: 步骤1,采集中药代谢的时间序列数据; 步骤2,针对所采集的中药代谢的时间序列数据,采用CCM算法获取中药代谢过程中各物质间的局部和全局因果关系; 步骤3,根据获取到的各物质间的局部和全局因果关系,通过滑动窗口技术结合加权的皮尔逊相关性构建动态物质-物质相关网络; 步骤4,利用PisCES算法检测代谢过程中的刚性物质簇;所述刚性物质簇指代谢过程中始终保持紧密关系的物质; 步骤5,根据构建的动态物质-物质相关网络的动态拓扑属性分析中药代谢过程中各物质的重要性从而确定在代谢过程中的核心物质以及核心物质群; 所述步骤2包括: 步骤2.1,分别为和建立阴影流形,对物质u的时间序列数据进行E维滞后嵌入后得到τ表示时间滞后;这些向量构成的集合记作阴影流形同样的方式得到; 步骤2.2,通过计算欧氏距离找到时间t的E+1个最近邻居,t1,...,ti,...,tE+1分别表示xut的时间下标,距离由近及远; 步骤2.3,计算第i个最近邻居的权重wi,其中di=exp{-dis[xut,xuti]dis[xut,xut1]}; 步骤2.4,利用找到的E+1个最近邻居对应的时间下标,通过该E+1个时间下标对应值计算估计值记作 步骤2.5,计算和之间的皮尔逊相关系数ρuv: 用cuv表示由原因u对结果v的影响,即由物质u指向物质v的单向因果得分: 即获得中药代谢过程中各物质间的局部因果关系; 步骤2.6,以各物质作为节点,因果关系得分cuv作为由节点u指向v的有向边的权重,构建加权有向的因果网络;对因果网络进行拓扑分析,以因果网络中节点的出度入度分别代表物质在代谢系统中作为原因和结果的影响力强度;节点的度中心性cu=cu:+c:u作为物质的重要性指标,即获得中药代谢过程中各物质间的全局因果关系。
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