笙源生命科技(浙江安吉)有限公司李君获国家专利权
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龙图腾网获悉笙源生命科技(浙江安吉)有限公司申请的专利一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119049567B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-22发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411081163.7,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法是由李君;姚恒;江静设计研发完成,并于2024-08-08向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法,该方法基于单细胞测序技术,不依赖测序前细胞分离,利用多重基因组比对分离多物种混合样本。其中所述基于多重基因组比分离多物种混合物的计算方法包括:根据样本多次无监督比对至目标物种参考基因组结果中的遗传物质比例进行统计学分布建模;根据遗传物质比例的统计学分布建模进行样本来源概率预测。本发明所建立的基于多重基因组比的多物种样本分离方法能够对异种杂交生物学样本中不同物种的遗传物质的来源进行较为精准的判定。
本发明授权一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于多重基因组比的多物种样本分离方法,其特征在于,建立一套异种杂交生物学样本生物学来源判别方法,所述方法的步骤如下: 1从未作额外标记的嵌合动物样本中获取组织样本; 2获取组织样本混合物种细胞悬液,不做额外标记、分离,沉淀处理,直接进行单细胞测序; 3获取嵌合组织单细胞转录组; 4对嵌合组织单细胞转录组每个细胞独立进行多重比对; 5将每个细胞测序读段分别对比到宿主与嵌合物种标准参考基因组; 所述步骤4-5中的标准序列比对结果中提取的每个细胞的比对信息,来自比对算法结果中测序序列读段逐条比对结果的文件,提取的字段包括比对成功的结果、比对位置、比对质量和多重比对的结果; 6将每个细胞的宿主与嵌合物种比对记录纳入统计分布分析,获得全部细胞多重比对结果的统计分布模式; 7计算多重比对分离阈值; 所述步骤6-7的具体步骤如下: a.统计嵌合组织单细胞转录组细胞多重比对结果宿主与嵌合细胞比对成功比例在所有细胞中的分布; b.根据多重比对结果概率绘制比对成功比例分布曲线; c.根据比对成功比例分布曲线计算各个分布区间内比对成功比例变化速率; d.根据变化速率,并参考嵌合样本具体实验观测结果计算分离阈值; 8根据阈值标记分离宿主和嵌合细胞,具体步骤如下: a.根据设定的宿主物种阈值,标记多重比对成功比例大于该阈值的细胞为宿主细胞; b.根据标记,对单细胞转录组测序数据进行分离。
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