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当前位置 : 首页 > 专利喜报 > 国开启科量子技术(安徽)有限公司;国开启科量子技术(北京)有限公司;启科量子技术(珠海)有限公司王挺波获国家专利权

国开启科量子技术(安徽)有限公司;国开启科量子技术(北京)有限公司;启科量子技术(珠海)有限公司王挺波获国家专利权

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龙图腾网获悉国开启科量子技术(安徽)有限公司;国开启科量子技术(北京)有限公司;启科量子技术(珠海)有限公司申请的专利用于提取蛋白属性特征的方法、装置、设备及介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117059158B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310843414.X,技术领域涉及:G16B15/20;该发明授权用于提取蛋白属性特征的方法、装置、设备及介质是由王挺波;周卓俊;韩琢;罗乐设计研发完成,并于2023-07-10向国家知识产权局提交的专利申请。

用于提取蛋白属性特征的方法、装置、设备及介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种用于提取蛋白属性特征的方法、装置、设备及介质,涉及生物信息及数据处理技术领域,其中的方法包括:从候选化合物数据中分离出小分子配体数据、蛋白口袋数据和蛋白分子数据;分别计算每个小分子配体数据中每类原子的重心坐标及每个蛋白分子数据中每类原子的重心坐标;分别将每个小分子配体数据、蛋白口袋数据和蛋白分子数据转换成分子向量;将多个蛋白分子进行序列对齐;从对齐的蛋白分子序列中提取出每一个氨基酸的中心碳坐标;基于每个小分子配体数据中的原子坐标和每个蛋白口袋数据中的原子坐标生成表征所述小分子配体和所述蛋白口袋空间结构的空间向量。本发明能够有效提高机器学习模型在分子筛选过程中的预测精度。

本发明授权用于提取蛋白属性特征的方法、装置、设备及介质在权利要求书中公布了:1.一种用于提取蛋白属性特征的方法,其特征在于,包括: 从化合物数据文件中提取多个候选化合物数据; 分别从每个候选化合物数据中分离出小分子配体数据、蛋白口袋数据和蛋白分子数据,得到多个小分子配体数据、多个蛋白口袋数据和多个蛋白分子数据; 分别计算每个小分子配体数据中每类原子的重心坐标及每个蛋白分子数据中每类原子的重心坐标; 分别将每个小分子配体数据、每个蛋白口袋数据和每个蛋白分子数据转换成相应的分子向量,得到多个小分子配体分子向量、多个蛋白口袋分子向量及多个蛋白分子向量; 分别将多个所述蛋白分子数据进行序列对齐,得到多个蛋白分子序列; 分别从多个所述蛋白分子序列中提取出每一个氨基酸的中心碳坐标,并组成蛋白氨基酸中心碳坐标数列; 基于每个候选化合物数据中的每个小分子配体数据中的原子坐标和每个蛋白口袋数据中的原子坐标,分别生成表征所述小分子配体和所述蛋白口袋空间结构的空间向量; 将每个小分子配体中每类原子的重心坐标组成的第一集合、每个蛋白分子中每类原子的重心坐标组成的第二集合、每个小分子配体分子向量组成的第三集合、每个蛋白口袋分子向量组成的第四集合、每个蛋白分子向量组成的第五集合、每个表征小分子配体和蛋白口袋空间结构的空间向量组成的第六集合以及蛋白氨基酸中心碳坐标数列组成的第七集合作为不同类的蛋白属性特征,其中,所述蛋白属性特征用于构成机器学习模型的输入向量,所述机器学习模型用于预测分子筛选过程中预置打分项的分值; 其中,生成表征小分子配体和蛋白口袋空间结构的空间向量的步骤包括: 基于所述小分子配体数据中的原子及原子坐标生成小分子配体原子矩阵; 以小分子配体原子矩阵中的每一个小分子配体原子为计算对象,分别计算所述计算对象与每一个蛋白口袋原子的空间距离; 将距离最小的蛋白口袋原子作为与计算对象对应的目标蛋白口袋原子,并获取目标蛋白口袋原子坐标; 基于目标蛋白口袋原子及目标蛋白口袋原子坐标生成蛋白口袋原子矩阵; 基于所述小分子配体原子矩阵得到第一坐标向量,基于蛋白口袋原子矩阵得到第二坐标向量,每种坐标向量分别包括坐标x向量、坐标y向量和坐标z向量; 以第一坐标向量中的任意两个向量作为自变量,以第二坐标向量中的相应两个向量作为参考量,基于预置变换核函数分别计算得到空间向量的一个坐标值。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人国开启科量子技术(安徽)有限公司;国开启科量子技术(北京)有限公司;启科量子技术(珠海)有限公司,其通讯地址为:230031 安徽省合肥市高新区望江西路900号中安创谷科技园一期A4栋三层049号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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