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中国农业大学李天忠获国家专利权

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龙图腾网获悉中国农业大学申请的专利一种基因组生殖区域定位方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118824375B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-15发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410909361.1,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种基因组生殖区域定位方法是由李天忠;王宝安;林涛;王圣元设计研发完成,并于2024-07-08向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基因组生殖区域定位方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基因组生殖区域定位方法。该方法具体包括基因组重组抑制区域定位和生殖相关区域定位两个步骤。其中基因组重组抑制区域定位又包括过滤低序列相似性、高重复序列含量、低基因密度的区间共三步,得到目标物种的重组抑制区间;在此基础上,提取目标物种的生殖器官特异表达基因集,统计其在各重组抑制区间的分布情况,可获得被子植物基因组的生殖相关区域,帮助科研人员加速对植物生殖区域的研究。

本发明授权一种基因组生殖区域定位方法在权利要求书中公布了:1.一种基因组生殖区域定位方法,其特征在于,包括如下步骤: 步骤1,基因组重组抑制区域定位; 步骤2,生殖相关区域定位; 所述步骤1的具体步骤为: 步骤1-1,对比目标物种和该目标物种的近缘物种的基因组序列,计算所述目标物种和目标物种的近缘物种全基因序列的序列相似性及不同区间序列片段之间的序列相似性;检测上述每个区间序列片段的序列相似性与全基因组序列相似性之间的差值是否达到显著水平,保留序列相似性显著低于全基因组平均值的区间; 步骤1-2,对目标物种的基因组序列进行重复序列注释,提取位置信息,在步骤1-1过滤序列相似性结果的基础上,统计每个区间序列中的重复序列含量,检测上述每个区间序列片段中的重复序列含量与全基因组重复序列含量之间的差值是否达到显著水平,保留重复序列含量显著高于全基因组中重复序列含量的区间; 步骤1-3,将目标物种的基因注释文件格式化,保留必要位置信息;在步骤1-1过滤序列相似性和步骤1-2过滤重复序列密度的基础上,统计每个区间序列片段中的基因密度,检测上述每个区间序列片段中的基因密度与全基因组基因密度之间的差值是否达到显著水平,保留基因密度显著低于全基因组基因密度的区间,即得基因组重组抑制区域; 所述步骤2的具体步骤为: 步骤2-1,获取目标物种的花组织及其他组织的基因表达量,筛选只在花组织中有表达但在其他组织中不表达的基因,得到目标物种的生殖器官特异表达基因集;所述其他组织为目标物种的根组织、茎组织、叶组织、果实组织、卷须组织、幼苗组织和莲座组织; 步骤2-2,统计步骤2-1获得的生殖器官特异表达基因集中各个基因在步骤1所得目标物种基因组各重组抑制区域的分布情况,选取包含上述生殖器官特异表达基因数量多及上述生殖器官特异表达基因占比高的区域,即得基因组上生殖相关区域。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国农业大学,其通讯地址为:100193 北京市海淀区圆明园西路2号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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