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龙图腾网获悉北京大学申请的专利一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120015121B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-08发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411777385.2，技术领域涉及：G16B30/00；该发明授权一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法是由佘坚祺;杨恩策设计研发完成，并于2024-12-05向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法在说明书摘要公布了：本发明涉及生物信息学技术领域，特别是涉及一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法。本发明提出了以teRNA的外显子水平为分析对象，相对于teRNA位点，teRNA外显子不仅实现了更精准的位点鉴定，还保留了TE在转录产物中存在的形式，包括是否提供了剪接位点和多聚腺苷酸信号，以及是否与基因或其他TE位点嵌合等。而相对于teRNA转录本水平，作为转录本的组成部分，teRNA外显子将短读长测序数据的序列组装难度显著降低。本发明结合贝叶斯模型、有参组装算法和局部位点从头组装算法，通过不同组装算法的相互校正，以及组装前后反复比对测序读长，降低组装的假阳性，从而提高了teRNA识别的准确性。

本发明授权一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法在权利要求书中公布了：1.一种基于RNA测序数据的转座元件来源RNA的鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：1teRNA位点的筛选；2teRNA来源测序读长的组装；3teRNA的识别； 步骤1所述teRNA位点的筛选包括以下步骤： 1.1获取待测样本的双端RNA的测序数据； 1.2将所述测序数据比对到参考基因组上，得到比对结果文件； 1.3对所述测序数据的测序读长进行分配，保留测序读长数0的teRNA位点； 步骤2所述teRNA来源测序读长的组装包括以下步骤： 2.1提取所述比对结果文件中teRNA位点对应的比对结果，得到teRNA比对结果文件；所述teRNA位点为步骤1筛选得到的teRNA位点； 2.2以参考基因注释文件为指导，使用StringTie软件对所述teRNA比对结果文件进行有参组装，参数为-G，得到第一组装序列； 2.3使用SERVE软件的识别模块对所述teRNA比对结果文件进行局部位点从头组装，参数--count设为1，得到第二组装序列； 2.4合并所述第一组装序列和所述第二组装序列，得到组装总序列； 步骤3所述teRNA的识别包括以下步骤： 3.1提取所述组装总序列中的单外显子转录本序列，使用BEDTools的merge模块进行序列合并，得到去冗余的单外显子转录本序列； 3.2提取所述组装总序列中多外显子转录本的外显子序列，与所述去冗余的单外显子转录本序列进行比对合并，得到去冗余的外显子序列；所述比对合并的方法包括：将所述外显子序列和所述单外显子转录本序列进行区间比较，对于与单外显子转录本序列重叠的外显子序列，取重叠外显子序列的区间并集； 3.3提取所述去冗余的外显子序列中的teRNA外显子，并使用BEDTools软件的coverage模块进行覆盖度计算； 3.4剔除测序覆盖度85％的teRNA外显子，得到定性识别的teRNA。

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