曲阜师范大学袁玉卓获国家专利权
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龙图腾网获悉曲阜师范大学申请的专利基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法、系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119807783B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510299888.1,技术领域涉及:G06F18/23;该发明授权基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法、系统是由袁玉卓;金洋;葛道辉;李浩楠;赵吉泉设计研发完成,并于2025-03-14向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法、系统在说明书摘要公布了:本发明属于单细胞多组学数据分析技术领域,具体涉及基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法、系统,通过自注意力机制和跨组学注意力机制实现了多组学数据的动态交互,引入深度学习门控机制,自适应调整特征选择和动态特征融合,能够灵活应对不同细胞类型和状态的变化,从而更好地揭示细胞的异质性;实现对细胞特征表示的细粒度处理以消除噪声的影响,提高聚类精度。
本发明授权基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法、系统在权利要求书中公布了:1.一种基于跨组学注意力融合的单细胞多组学聚类方法,其特征在于,包括以下步骤: S1:获取单细胞基因表达数据,经SCANPY方法处理后,通过主成分分析进行降维,得到基因表达矩阵; 获取单细胞染色质可及性数据,利用潜在语义索引方法进行降维,得到峰值矩阵; 根据基因表达矩阵和峰值矩阵,分别计算细胞间的欧几里得矩阵,得到相应的距离矩阵,根据距离矩阵,分别以欧几里得距离的倒数计算相应的相似度后,对于每个细胞,将相似度满足K近邻法的细胞进行连接,分别构建基因表达细胞图和染色质可及性细胞图; S2:基因表达矩阵和基因表达细胞图分别提取潜在表示,提取的潜在表示进行线性加权,得到转录组学的细胞特征表示,记为第一细胞特征表示; 峰值矩阵和染色质可及性细胞图分别提取潜在表示,提取的潜在表示进行线性加权,得到表观基因组学的细胞特征表示,记为第二细胞特征表示; S3:第一细胞特征表示、第二细胞特征表示分别经自注意力机制处理,计算每个组学细胞间的分配权重,生成相应组学的第三细胞特征表示; 将其它组学细胞间的分配权重编码至当前组学,加权求和,生成当前组学的第四细胞特征表示; 当前组学的第四细胞特征表示与第三细胞特征表示进行融合,得到当前组学的融合特征表示; S4:融合特征表示解耦后,依次经元素相乘、相加,得到门控转换特征;门控转换特征与第一细胞特征表示或第二细胞特征表示进行残差连接处理,得到相应组学的调整融合特征; S5:相应组学的调整融合特征分别利用K均值聚类算法,得到每个组学的初始聚类中心;基于初始聚类中心,计算每个组学的软分配矩阵,整合所有组学的软分配矩阵,得到单细胞的聚类标签。
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