重庆医科大学张永红获国家专利权
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龙图腾网获悉重庆医科大学申请的专利基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝毒性差异的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115579052B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211219864.3,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝毒性差异的方法是由张永红;蔡雄;谈丹;甘晓凤;周成成设计研发完成,并于2022-10-05向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝毒性差异的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝脏毒性差异性的方法。本发明方法包括以下步骤:在数据库挖掘药物的作用靶点、肝脏毒性疾病风险基因,构建药物性肝损伤疾病模块DILI的蛋白相互作用网络,对风险基因进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;对药物靶点和DILI疾病模块进行网络重叠并分析药物肝脏毒性机制;采用网络邻近策略计算药物与DILI疾病模块的邻近程度;最后对药物分子和核心靶点进行分子对接。本发明方法揭示了H2受体拮抗剂相比质子泵抑制剂具有更强的肝脏毒性,探究了药物潜在肝脏损伤的机制,为后续药物的肝脏毒性研究提供参考。
本发明授权基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝毒性差异的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于网络毒理学分析质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂肝脏毒性差异性的方法,包括如下步骤: (1).药物靶点的获取和处理:通过在线数据库获取质子泵抑制剂与H2受体拮抗剂的作用靶点,靶点在蛋白质数据库进行处理以匹配相关基因符号; (2).肝脏毒性风险基因的获得和处理:采用ChemicalandDrugInducedLiverInjury、ChemicalandDrugInducedLiverInjury,Chronic作为关键词在MeSH数据库检索,根据检索结果在OMIM数据库和GWAS数据库获取肝脏毒性风险基因,去除未成功映射的基因及重复项; (3).构建药物性肝损伤疾病模块:将收集的肝脏毒性风险基因定位于STRING,根据网络定位观察疾病风险基因的分布,通过网络的随机化验证DILI疾病模块的有效性,得到DILI疾病模块; (4).药物与DILI疾病模块的网络邻近:使用网络邻近策略评估药物与DILI疾病模块的接近程度,利用代码计算药物靶点同DILI疾病模块风险基因的邻近程度:对于给定疾病基因集V和药物靶点集T,dV,T表示网络节点中v和t之间最短的路径长度,dcV,T表示网络中药物靶点与疾病风险基因的平均最短路径长度,计算公式如下:; 药物和DILI疾病模块之间的相对平均最短距离Zdc的计算公式如下所示,通过网络邻近的计算,得到网络邻近结果; (5).药物和DILI疾病模块的网络重叠:通过代码将药物靶点和风险基因在STRING网络进行网络重叠,计算药物靶点与风险基因的ds值,分析药物肝脏毒性机制的差异性及药物与疾病模块的网络关联性; (6).DILI疾病模块的基因富集:将DILI疾病模块的所有风险基因上传到DAVID生物信息学数据库进行基因富集,得到的结果用于分析药物性肝损伤疾病的生物过程、分子功能及相关信号通路,探究药物性肝损伤的相关机制; (7).筛选药物作用于疾病模块的核心靶点:将药物靶点与疾病风险基因重合,得到药物作用于疾病模块的候选核心靶点,统计基因富集结果中所有信号通路涉及的基因的频次,统计候选核心靶点对应的频次排序;将疾病风险基因上传到STRING数据库分析,得到靶点蛋白相互作用网络PPI及其txt.数据,使用Cytoscape3.9.0软件中的NetworkAnalyzer模块分析txt.数据的最大自由度值;结合候选核心靶点在PPI网络中的度值排名及候选核心靶点的基因频次排序,筛选确定药物作用在疾病模块的核心靶点; (8).药物和核心靶点的分子对接:核心靶点在PDB蛋白质数据库下载对应的人源性蛋白结构,在PubChem数据库下载药物的2D结构作为配体文件,使用DiscoveryStudio2019软件进行分子对接。
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