买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

龙图腾网获悉中国科学院海洋研究所申请的专利一种构建牡蛎单倍型基因组的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115992261B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-24发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211603430.3，技术领域涉及：C12Q1/6888；该发明授权一种构建牡蛎单倍型基因组的方法是由亓海刚;王彦俊;丛日浩;李莉;张国范设计研发完成，并于2022-12-13向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种构建牡蛎单倍型基因组的方法在说明书摘要公布了：本发明属于海洋生物基因组和分子遗传学领域，具体涉及到一种构建牡蛎单倍型基因组的方法。选取一个牡蛎雄性和一个雌性个体，人工构建全同胞家系并对后代进行常规养殖；将父本和母本个体分别进行高通量测序，鉴定父本特异性单核苷酸变异位点和母本特异性单核苷酸变异位点；后代个体养殖一年后，取一个体进行高通量测序；利用双亲特异性单核苷酸变异位点对后代个体的测序序列进行分组，获得父源后代序列和母源后代序列；将父源和母源后代序列分别进行组装，获得父源和母源单倍型基因组。应用该方法获得长牡蛎和福建牡蛎高质量单倍型基因组，BUSCO评估基因组的完整性大于93％，表明该方法获得的牡蛎单倍型基因组质量较高。

本发明授权一种构建牡蛎单倍型基因组的方法在权利要求书中公布了：1.一种构建牡蛎单倍型基因组的方法，其特征在于， （1）选取牡蛎雌性和雄性个体，人工构建全同胞家系并对后代进行常规养殖； （2）后代个体养殖一年后，取一个体进行长序列高通量测序； （3）对全同胞家系的母本和父本个体分别进行短序列高通量测序； （4）利用后代测序序列进行初步组装； （5）将亲本序列比对到初步组装，鉴定亲本特异性单核苷酸变异位点； （6）利用亲本特异性单核苷酸变异位点对后代个体的测序序列进行分组，获得父本来源和母本来源的长序列； （7）利用hifiasm程序，以步骤（6）中获得的两个亲本来源的长序列；为输入，分别进行拼接组装，获得两个单倍型基因组序列； 所述步骤（2）取一个体进行长序列高通量测序；其中，长序列高通量测序采用PacBio公司的SMART测序模式，将原始数据的bam文件利用ccs程序进行处理，获得ccs序列，测序深度不低于60×； 所述步骤（3）将原始数据的fastq文件利用fastp程序进行过滤，获得成对的原始测序序列，短序列高通量测序深度均不低于50×，而后对雌、雄亲本个体的基因组大小、杂合度和重复序列比例进行估算； 将步骤（3）亲本的测序序列分别与步骤（4）获得基因序列进行比对，获得比对bam文件，利用Samtools程序的sort命令对bam文件中的序列进行排序，利用Picard程序去除bam文件中的PCR扩增导致的重复比对，利用gatk程序对父本bam和母本bam文件进行单核苷酸变异SNV检测，根据比对信息鉴定亲本特异性单核苷酸变异位点； 步骤（5）中获得的亲本特异性SNV在子代ccs序列中进行定位，统计在子代ccs序列中该SNV的等位基因碱基类型，所述亲本特异性单核苷酸变异位点为在两个亲本中基因型不同，且后代中存在亲本特异性等位基因的SNV基因型组合；其中，SNV基因型组合形式： （1）FF×MM，F为父本特异，M为母本特异； （2）FF×FM，F不能判定来源，M为母本特异； （3）FM×MM，F为父本特异，M不能判定来源； 其中F和M代表基因组DNA四种组成碱基A、C、G和T。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人中国科学院海洋研究所，其通讯地址为：266071 山东省青岛市市南区南海路7号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。