江南大学陆文伟获国家专利权
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龙图腾网获悉江南大学申请的专利基于饮食-肠道菌群-疾病数据库的膳食推荐模型构建方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118471437B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410425740.3,技术领域涉及:G16H20/60;该发明授权基于饮食-肠道菌群-疾病数据库的膳食推荐模型构建方法是由陆文伟;张惠琴;朱金林;王鸿超;翟齐啸;陈卫;张灏设计研发完成,并于2024-04-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于饮食-肠道菌群-疾病数据库的膳食推荐模型构建方法在说明书摘要公布了:本发明公开了基于饮食‑肠道菌群‑疾病数据库的膳食推荐模型构建方法,属于数据库及膳食推荐技术领域。本发明数据库由整合相关开源数据库及文献纳入构成,并对数据库内容进行标准化处理,该膳食推荐模型的构建方法包括如下步骤:步骤1:基于数据库,通过语义相似性、高斯核轮廓相似性计算和图注意力网络进行建模,构建饮食‑肠道菌群、肠道菌群‑疾病相关性网络;步骤2:基于数据库中的定性关系,对应相关性网络中的节点,从而构建饮食‑肠道菌群‑疾病网络;步骤3:通过分类器优化模型对肠道菌群的靶点筛选,得到不同疾病的膳食推荐结果。本发明能够提供一种饮食‑肠道菌群‑疾病领域的数据支持手段,根据人体健康疾病状况提供膳食建议。
本发明授权基于饮食-肠道菌群-疾病数据库的膳食推荐模型构建方法在权利要求书中公布了:1.一种膳食推荐模型的构建方法,其特征在于,所述方法包括: 步骤1:构建饮食-肠道菌群-疾病数据库; 步骤2:基于所述饮食-肠道菌群-疾病数据库,通过语义相似性、高斯核轮廓相似性计算和图注意力网络进行建模,构建饮食-肠道菌群、肠道菌群-疾病相关性网络; 步骤3:基于所述饮食-肠道菌群-疾病数据库中的定性关系,对应所述相关性网络中的节点,从而构建饮食-肠道菌群-疾病网络; 步骤4:通过分类器优化模型对肠道菌群的靶点筛选,得到不同疾病的膳食推荐结果; 所述步骤2包括: 步骤21:构建饮食-肠道菌群、肠道菌群-疾病邻接矩阵; 其中,分别代表微生物群-疾病和饮食-微生物关联,Nm、Nd、Nf分别表示微生物、疾病和饮食的数量,如果微生物群mi和疾病dj、饮食fi和微生物群mi之间存在已验证的关联,则Ai,j、Bi,j的值设置为1,否则为0; 步骤22:根据邻接矩阵进行高斯核轮廓相似性计算,计算过程如下: KDdx,dy=exp-γd||IPdx-IPdy||2 其中,KDdx,dy表示疾病x和疾病y的高斯核轮廓相似性,IPdx表示疾病x在邻接矩阵中与每个微生物的相互作用谱,γd为归一化核带宽,γ′d参数根据相关研究设为0.5; 微生物、饮食的高斯核轮廓相似性KDmx,my、KDfx,fy与上述计算过程相同; 步骤23:根据MeSH词汇和PubMed数据库组合构建的疾病-症状关联进行疾病语义相似性计算,并将疾病的相似性进行归一化,计算过程如下: dj=w1,j,w2,j,...,wn,j 其中,wi,j表示症状i和疾病j之间的关联强度,Wi,j表示症状i和疾病j之间的绝对共现度,N表示疾病的数量,Ni表示包含症状i的疾病数量,通过余弦相似性计算得到疾病x和疾病y的向量dx和dy之间基于症状的疾病相似性得分SDdx,dy,最后确定疾病相似性DSdx,dy; 步骤24:根据微生物、疾病、饮食相似性矩阵、邻接矩阵,通过图注意力网络分别构建饮食-肠道菌群相似性网络、肠道菌群-疾病相似性网络,计算过程如下: Hl=fHl-1,X Hl表示嵌入在第l层中的节点,eij为微生物i和疾病j之间的注意力系数,μ为可训练权重矩阵W参数化的单层前馈神经网络,将输入特征h进行线性变换;初始输入特征h是一堆节点的集合,N表示包括一组特征的节点的数量,进一步通过softmax函数将注意力系数eij归一化为αij,LeakyReLU表示激活函数,||表示连接操作,为每个节点的输出特征,minLoss为最小损失函数,其中Km和Kd为两个特征空间向量,Wm和Wd为训练矩阵,A为微生物和疾病关联矩阵的训练集,||||F为Frobenius范数,λm和λd为正则化系数,Lm和Ld为拉普拉斯正则化矩阵; 所述步骤3包括: 步骤31:根据所述步骤2得到的饮食-肠道菌群、肠道菌群-疾病相似性网络,以相关性得分对于不同疾病的微生物进行重要性排序,选择占比为总和80%的微生物作为干预靶点; 步骤32:结合数据库中饮食疾病-肠道菌群的定性知识和相似性网络中的定量知识,通过共同的肠道微生物关联饮食与疾病,得到针对疾病j的饮食i的推荐系数FiDj,计算如下: 其中,FiMk表示饮食i与微生物k的相关系数,MkDj表示微生物k与疾病j的相关系数,且相关系数经过数据库定性知识的校正,如正相关,不变,负相关则需为负数。
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