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山东合成生物技术有限公司林满获国家专利权

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龙图腾网获悉山东合成生物技术有限公司申请的专利一种合成生物益生菌的筛选方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119252334B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-20发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411429435.8,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种合成生物益生菌的筛选方法及系统是由林满;华晓曼;刘明刚设计研发完成,并于2024-10-14向国家知识产权局提交的专利申请。

一种合成生物益生菌的筛选方法及系统在说明书摘要公布了:本发明属于合成生物益生菌筛选技术领域,具体为一种合成生物益生菌的筛选方法及系统,搜索DNA序列中的目标区域,统计目标区域中的K‑mer频率,将前k位碱基相同的K‑mer的频率按照K‑mer剩余部分碱基字母顺序依次放入到一个集合中,将所有集合按照前k位碱基字母顺序按行拼接为目标区域的频率特征矩阵,将所有目标区域的频率特征矩阵构成多通道频率特征矩阵,将多通道频率特征矩阵输入到具有通道注意力模块的神经网络模型中进行训练;从待筛选的合成生物益生菌的DNA序列得到待筛选的合成生物益生菌的多通道频率特征矩阵,将多通道频率特征矩阵输入到训练后的神经网络模型中得到合成生物益生菌的得分。本发明能够提高合成生物益生菌初筛的效率。

本发明授权一种合成生物益生菌的筛选方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种合成生物益生菌的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:获取训练样本中有益菌和非有益菌的DNA序列,搜索所有DNA序列中位置相同、DNA片段相同的区域,将DNA序列中剩余的区域作为目标区域;其中,所述DNA片段的长度不小于预设值;统计目标区域中的K-mer频率,将前k位碱基相同的K-mer的频率按照K-mer剩余部分碱基字母顺序依次放入到一个集合中,具体为:获取所有前k位碱基相同的K-mer对应的频率,按照剩余的碱基字母的顺序对所述频率进行排序,将排序后的频率放入到前k位碱基标识的集合中;将所有集合按照前k位碱基字母顺序按行拼接为目标区域的频率特征矩阵,将所有目标区域的频率特征矩阵构成多通道频率特征矩阵,将多通道频率特征矩阵输入到具有通道注意力模块的神经网络模型中进行训练;其中,通道注意力模块包括的通道权重计算单元,用于统计目标区域的功能元件,对不同的功能元件设置不同的权重,计算目标区域所有功能元件的权重,将所有目标区域的权重进行归一化得到归一化后的通道权重,得到通道权重向量;通道权重计算单元或者用于对于每个目标区域获取训练样本所有有益菌中所述目标区域同一个位置每种碱基出现的频率,并获取训练样本中所有非有益菌中所述目标区域同一个位置每种碱基出现的频率,基于所述频率得到目标区域对于区分有益菌和非有益菌的贡献度,将所有目标区域的贡献度进行归一化得到归一化后的通道权重,得到通道权重向量;从待筛选的合成生物益生菌的DNA序列得到待筛选的合成生物益生菌的多通道频率特征矩阵,将多通道频率特征矩阵输入到训练后的神经网络模型中得到合成生物益生菌的得分。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人山东合成生物技术有限公司,其通讯地址为:264200 山东省威海市经济技术开发区大庆路45-1号E1楼21楼2108室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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