天津大学田裕涛获国家专利权
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龙图腾网获悉天津大学申请的专利一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN118737300B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-17发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202410817091.1，技术领域涉及：G16C10/00；该发明授权一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法是由田裕涛;李健林;高志伟;焦玉华设计研发完成，并于2024-06-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法，所述的路径识别方法包括采用常规分子动力学模拟将配体门控离子通道从约束状态释放，模拟配体结合到配体门控离子通道的随机过程，再进行靶向分子动力学模拟，在靶向分子动力学模拟后再次进行常规分子动力学模拟进一步优化配体门控离子通道的结构，使其处于弛豫状态。采用高斯加速分子动力学模拟平滑配体门控离子通道势能表面并减少能量障碍，进一步结合动态网络分析等方法，分析配体门控离子通道与配体结合的位点及变构路径，对于研究配体门控离子通道与配体结合的作用机制以及开发新的变构调节剂具有重要意义。
本发明授权一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法在权利要求书中公布了：1.一种基于分子动力学模拟配体门控离子通道的路径识别方法，其特征在于，所述的方法包括： 步骤一：获取配体门控离子通道的Holo态和Apo态的晶体结构作为初始结构，构建模拟体系； 步骤二：对模拟体系进行常规分子动力学模拟，获得配体门控离子通道与配体结合的初始轨迹并提取出配体门控离子通道与配体结合的代表姿态结构； 步骤三：对配体门控离子通道与配体结合的代表姿态结构和Holo态的晶体结构进行靶向分子动力学模拟，提取初始中间态结构； 步骤四：对初始中间态结构进行常规分子动力学模拟，获得中间态稳定轨迹并提取中间态稳定结构； 步骤五：对中间态稳定结构进行高斯加速分子动力学模拟，获得高斯加速分子动力学模拟轨迹； 步骤六：对步骤四获得的中间态稳定轨迹与步骤五获得的高斯加速分子动力学模拟轨迹进行动态网络分析，获得配体与配体门控离子通道结合的变构路径。
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