浙江大学陶峰获国家专利权
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龙图腾网获悉浙江大学申请的专利一种分析肿瘤细胞CIN表观遗传特征的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119162318B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411275654.5,技术领域涉及:C12Q1/6886;该发明授权一种分析肿瘤细胞CIN表观遗传特征的方法是由陶峰;孙德强设计研发完成,并于2024-09-12向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种分析肿瘤细胞CIN表观遗传特征的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及单细胞多组学测序技术领域,公开了一种分析肿瘤细胞CIN表观遗传特征的方法,步骤包括:制备单细胞RNA文库和DNA文库,测序;分别对DNA和RNA测序数据进行预处理,比对到人类基因组参考序列,鉴定出差异甲基化区域,进行细胞核型分析,将肿瘤细胞划分成不同亚组,并定量基因表达水平;分析不同亚组间DNA甲基化差异、基因表达差异和核型异质性之间的相关性。本发明的方法能够同时测量单细胞的DNA甲基化、基因表达和细胞核型,并在此基础上分析肿瘤细胞DNA甲基化、基因表达和核型异质性之间的相关性,有助于更加深入地理解肿瘤发生和进化的机理。
本发明授权一种分析肿瘤细胞CIN表观遗传特征的方法在权利要求书中公布了:1.一种分析肿瘤细胞染色体不稳定性表观遗传特征的方法,其特征在于,包括: 1)从单个肿瘤细胞中提取RNA和基因组DNA;将RNA制备成RNA文库后测序;对基因组DNA依次进行MspI酶切反应,末端修复和加A尾反应,亚硫酸盐转化,用SEQIDNO.1所示随机引物扩增,用通用PCR引物和索引引物进行文库扩增,得DNA文库后测序; 2)DNA文库测序数据预处理后比对到基因组参考序列,鉴定出差异甲基化区域;用AneuFinder软件,输入排序后的BAM文件和参考基因组索引;获取比对到对应参考基因组位置的读取的碱基数,估算各基因片段拷贝状态;用AneuFinder软件绘染色体概览图;将每个s与对应L相乘后求和,再除以所有L之和得染色区段拷贝数,s是各片段的染色体区段倍性特征,s1,L是各染色体区段状态对应的片段长度;根据单细胞之间核型异质性将肿瘤细胞划分成不同亚组; 3)RNA文库测序数据预处理后比对到基因组参考序列,定量基因表达水平; 4)根据步骤2)和3)所得结果,分析不同亚组间DNA甲基化差异和基因表达差异之间的相关性,并鉴定出不同亚组之间在启动子区发生了差异甲基化且可能与核型差异相关的基因,再对这些基因进行无进展生存期分析。
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