四川大学华西医院杨晓妍获国家专利权
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龙图腾网获悉四川大学华西医院申请的专利一种AAV2衣壳蛋白变体设计方法、系统和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119380820B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411411219.0,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种AAV2衣壳蛋白变体设计方法、系统和存储介质是由杨晓妍;何玮;周小波;罗杨钖;雷倩;罗佳伟;来钰开设计研发完成,并于2024-10-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种AAV2衣壳蛋白变体设计方法、系统和存储介质在说明书摘要公布了:本发明属于基因治疗领域,具体涉及一种AAV2衣壳蛋白变体设计方法、系统和存储介质。本发明的系统包括预处理模块,被配置为:对收集的AAV2衣壳蛋白的序列数据,进行预处理;输入模块,被配置为:输入不同序列长度的AAV2衣壳蛋白序列;预测模块,被配置为:通过微调的AntiBERTy模型对AAV2衣壳蛋白序列分类,根据序列的功能性评分,获得AAV2衣壳蛋白变体序列;输出模块,被配置为:输出所述预测模块的序列。本发明能生成不同长度且具有功能性的高质量蛋白序列,显著提升生成序列的同源性与多样性,准确预测序列的功能性特征,从而实现对AAV2衣壳蛋白变体的有效筛选。
本发明授权一种AAV2衣壳蛋白变体设计方法、系统和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种AAV2衣壳蛋白变体设计系统,其特征在于,包括: 预处理模块,被配置为:对收集的AAV2衣壳蛋白的序列数据,进行预处理; 输入模块,被配置为:输入不同序列长度的AAV2衣壳蛋白序列;所述不同序列长度的AAV2衣壳蛋白序列由微调的Progen2模型生成;所述微调的Progen2模型通过损失函数调整模型参数,生成不同序列长度的AAV2衣壳蛋白序列;所述损失函数计算公式如下: 上式中L表示计算所得损失,表示实际token的值,表示模型预测的token输出值; 预测模块,被配置为:通过微调的AntiBERTy模型对不同序列长度的AAV2衣壳蛋白序列分类,根据序列的功能性评分,获得AAV2衣壳蛋白变体序列;所述微调的AntiBERTy模型包括AntiBERTy网络层和MLP网络层;所述AntiBERTy网络层包括表征序列隐藏层和平均池化层;所述表征序列隐藏层包括第一层特征提取层、第二层特征提取层以及最后一层特征提取层,所述平均池化层将所述第一层特征提取层、第二层特征提取层以及最后一层特征提取层得到的特征进行拼接; 输出模块,被配置为:输出所述预测模块的序列。
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